జర్నల్ ఆఫ్ క్లినికల్ ఎపిజెనెటిక్స్ అందరికి ప్రవేశం

క్యాన్సర్ ఎపిజెనెటిక్స్ మరియు డయాగ్నోస్టిక్స్

క్యాన్సర్ కణాలలో బాహ్యజన్యు మార్పులు ఔషధ చికిత్స కోసం కొత్త లక్ష్యాలను అందించడమే కాకుండా క్యాన్సర్ నిర్ధారణకు ప్రత్యేకమైన అవకాశాలను కూడా అందిస్తాయి. వ్యక్తిగత జన్యు స్థానం యొక్క బాహ్యజన్యు స్థితిని అంచనా వేయడానికి మూడు ప్రధాన విధానాలు (1) జన్యు వ్యక్తీకరణను కొలవడం, (2) హిస్టోన్ మార్పులు మరియు క్రోమాటిన్ ప్రోటీన్ కూర్పును నిర్ణయించడం మరియు (3) ప్రమోటర్ DNA మిథైలేషన్ స్థితిని విశ్లేషించడం. క్రోమాటిన్ ప్రోటీన్ కూర్పు మరియు మార్పులను విశ్లేషించడానికి క్రోమాటిన్ ఇమ్యునోప్రెసిపిటేషన్ చాలా ఉపయోగకరమైన పరిశోధనా సాధనం.

అయినప్పటికీ, మాస్ స్పెక్ట్రోమెట్రీ ద్వారా సీరం ప్రోటీమిక్స్‌కు విరుద్ధంగా, వైద్యపరంగా ఉపయోగకరమైన రోగనిర్ధారణ పద్ధతిగా ఇది ఇంకా తగినంతగా అభివృద్ధి చెందలేదు, ఇది క్లినికల్ ఫీజిబిలిటీ స్టడీస్‌లో వేగంగా అభివృద్ధి చెందుతోంది. జన్యు వ్యక్తీకరణ మైక్రోఅరే విశ్లేషణ క్యాన్సర్ యొక్క నవల ఉపవర్గాలను గుర్తించడానికి మరియు చికిత్సకు క్లినికల్ ఫలితం లేదా ప్రతిస్పందనను అంచనా వేయడానికి ఒక శక్తివంతమైన పద్ధతిగా నిరూపించబడింది. అయినప్పటికీ, జన్యు వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ సాధారణంగా బాహ్యజన్యు విశ్లేషణగా పరిగణించబడదు, ఎందుకంటే జన్యు నియంత్రణ యొక్క యాంత్రిక అవగాహన ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్ కారకాల ద్వారా ట్రాన్స్‌క్రిప్షనల్ నియంత్రణ యొక్క అధ్యయనాల నుండి ఉద్భవించింది, ఇది తప్పనిసరిగా మైటోటికల్‌గా స్థిరమైన బాహ్యజన్యు మార్పును కలిగి ఉండదు, అయినప్పటికీ జన్యు నియంత్రణ మరియు బాహ్యజన్యు శాస్త్ర రంగాలు దగ్గరికి వెళ్లడం.

రోగనిర్ధారణ సాధనంగా క్యాన్సర్ ఎపిజెనెటిక్స్‌లో ప్రధాన ఆసక్తి స్థానికీకరించిన బాహ్యజన్యు నిశ్శబ్దం. ప్రమోటర్ CpG ఐలాండ్ హైపర్‌మీథైలేషన్ కోసం అభ్యర్థులుగా లిప్యంతరీకరించబడని జన్యువులను గుర్తించడానికి జన్యు వ్యక్తీకరణ మైక్రోఅరే అధ్యయనాల ఉపయోగం పరిమిత విజయాన్ని సాధించింది, ఎందుకంటే జన్యు వ్యక్తీకరణ లేకపోవడం బాహ్యజన్యు నిశ్శబ్దం కాకుండా ఇతర కారణాల నుండి ఉత్పన్నమవుతుంది. చాలా వరకు, క్యాన్సర్ ఎపిజెనెటిక్స్ CpG ద్వీపం DNA హైపర్‌మీథైలేషన్ యొక్క కొలతలపై ఆధారపడింది.

DNA మిథైలేషన్ గుర్తులను క్యాన్సర్ నిర్ధారణలో వ్యాధి వర్గీకరణ మరియు వ్యాధి గుర్తింపు రెండింటికీ ఉపయోగిస్తారు. వర్గీకరణ సాధనంగా, CpG ద్వీపం హైపర్‌మీథైలేషన్ సాధారణంగా తగినంత పరిమాణంలో ఉన్న ప్రాధమిక కణజాలంపై విశ్లేషించబడుతుంది, ఉదాహరణకు శస్త్రచికిత్స ద్వారా మార్చబడిన కణితి నమూనా.

వ్యక్తిగత జన్యు ప్రమోటర్ల DNA మిథైలేషన్ స్థితి సాధారణ రోగ నిరూపణ కోసం లేదా నిర్దిష్ట చికిత్సకు ప్రతిస్పందనను అంచనా వేయడానికి ఉపయోగించవచ్చు. వ్యక్తిగత జన్యువుల హైపర్‌మీథైలేషన్ మరియు వివిధ రకాల క్యాన్సర్‌లకు సంబంధించిన మొత్తం క్లినికల్ ఫలితం (రోగ నిరూపణ) మధ్య అనుబంధాన్ని వివరించే అనేక నివేదికలు ఉన్నాయి. వ్యక్తిగత మిథైలేషన్ గుర్తులు కూడా రొమ్ము క్యాన్సర్ మెటాస్టాసిస్‌తో ముడిపడి ఉన్నాయి.

ప్రత్యేకించి, దండయాత్ర మరియు మెటాస్టాసిస్ కోసం E-క్యాథరిన్ (CDH1) ప్రమోటర్ యొక్క మిథైలేషన్ అవసరం. DNA మిథైలేషన్ మార్కర్ అనేది ఒక నిర్దిష్ట చికిత్సకు ప్రతిస్పందనను అంచనా వేస్తుంది మరియు చికిత్సతో సంబంధం లేకుండా క్లినికల్ ఫలితం యొక్క సాధారణ రోగనిర్ధారణ మార్కర్ మాత్రమే కాదు అని నిర్ధారించడం చాలా కష్టం.

O6-మిథైల్‌గువానైన్ మిథైల్‌ట్రాన్స్‌ఫేరేస్ (MGMT) ప్రమోటర్ యొక్క హైపర్‌మీథైలేషన్ కోసం ఉత్తమ కేసులలో ఒకటి తయారు చేయబడింది, ఇది ఆల్కైలేటింగ్ ఏజెంట్‌లతో చికిత్స పొందిన గ్లియోమా రోగులలో పెరిగిన మనుగడతో ముడిపడి ఉంది. యాంటీనియోప్లాస్టిక్ ఆల్కైలేటింగ్ సమ్మేళనం ఫోటెముస్టిన్‌కు ప్రతిఘటనను పొందిన మెలనోమా కణాలు, విట్రో డ్రగ్ ఎక్స్‌పోజర్‌లో పునరావృతం చేయడం ద్వారా, MGMT జన్యువును తిరిగి సక్రియం చేసినట్లు చూపబడింది.