బయోమెడిసిన్‌లో అంతర్దృష్టులు అందరికి ప్రవేశం

నైరూప్య

మాట్రిక్స్ మెటాలోప్రొటీనేస్‌పై రూటిన్ యొక్క మాలిక్యులర్ డాకింగ్ స్టడీస్

S. గురుదీబన్

మ్యాట్రిక్స్ మెటాలోప్రొటీనేస్ (MMP)ని మ్యాట్రిక్సిన్స్ అని కూడా పిలుస్తారు, గాయం నయం చేయడం, కణజాల ఇంజనీరింగ్ మరియు ఎంబ్రియోజెనిసిస్‌లో ముఖ్యమైన పాత్ర పోషిస్తుంది. MMP యొక్క చర్య అనేక అంతర్జాత కణజాల నిరోధకాలచే నిరోధించబడుతుంది, అయితే రోగలక్షణ స్థితికి సహజ లేదా సింథటిక్ మూలం నుండి బాహ్య నిరోధకం అవసరం. అందువల్ల, ప్రస్తుత అధ్యయనం మెటాలోప్రొటీనేస్‌పై రుటిన్ యొక్క నిరోధక ప్రభావాన్ని అంచనా వేయడానికి ఉద్దేశించబడింది. టార్గెట్ ప్రోటీన్ల యొక్క క్రియాశీల సైట్‌లు 3DLignadsite ద్వారా అంచనా వేయబడ్డాయి. లామార్కియన్ జన్యు అల్గోరిథం ఆధారంగా, ఆటోడాక్ 4.2ని ఉపయోగించి శక్తి కనిష్టీకరించబడిన రూటిన్ MMP2, MMP3, MMP8 మరియు MMP12తో డాక్ చేయబడింది. GLUలో -10.19kcalmol-1గా MMP2, LEUపై MMP8 -8.83kcalmol-1, THR, MMP3 -8.83kcalmol-1గా ALA, HIS మరియు MMP12 -6.08గా MMP2 యొక్క బైండింగ్ ఫ్రీ ఎనర్జీని ప్రదర్శించిన రూటిన్ పరస్పర చర్యను ఫలితం సూచిస్తుంది. kcalmol-1 CYS మరియు HIS57 అవశేషాలు. మేము రుటిన్‌ను సమర్థవంతమైన మ్యాట్రిక్స్ మెటాలోప్రొటీనేస్ ఇన్హిబిటర్‌గా నిర్ధారించాము. తదుపరి అధ్యయనాలు రుటిన్‌ను మ్యాట్రిక్స్ మెటాలోప్రొటీనేస్ ఇన్హిబిటర్‌గా ఉపయోగించడాన్ని నిర్ధారిస్తాయి.